Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
KDM2AQ9Y2K7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
KDM2AQ9Y2K7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
KDM2AQ9Y2K7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
KDM2AQ9Y2K7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms