Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKBQ9Y259 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms