Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9BQ9UPX0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms