Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNPO2Q9UMS6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms