Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPCN1Q9ULQ1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
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