Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
INO80Q9ULG1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
INO80Q9ULG1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms