Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKLN1Q9UL63 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MKLN1Q9UL63 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MKLN1Q9UL63 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKLN1Q9UL63 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKLN1Q9UL63 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms