Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HCN2Q9UL51 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN2Q9UL51 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN2Q9UL51 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN2Q9UL51 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN2Q9UL51 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN2Q9UL51 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN2Q9UL51 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN2Q9UL51 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN2Q9UL51 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN2Q9UL51 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN2Q9UL51 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN2Q9UL51 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN2Q9UL51 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms