Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PACSIN3Q9UKS6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms