Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCAN3Q9UKA8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN3Q9UKA8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms