Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNL1Q9UK58 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNL1Q9UK58 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms