Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAI1Q9UI46 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAI1Q9UI46 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAI1Q9UI46 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms