Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1NQ9UHG2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1NQ9UHG2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms