Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FBXO40Q9UH90 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO40Q9UH90 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms