Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms