Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT8Q9UFF9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms