Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NXF1Q9UBU9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NXF1Q9UBU9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms