Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms