Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK3Q9UBP4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK3Q9UBP4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms