Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPR1Q9UBH6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms