Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFIP11Q9UBB9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms