Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUCLA2Q9P2R7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SUCLA2Q9P2R7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms