Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
REREQ9P2R6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
REREQ9P2R6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms