Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHD7Q9P2D1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms