Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SENP1Q9P0U3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SENP1Q9P0U3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SENP1Q9P0U3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms