Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms