Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PODXL2Q9NZ53 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms