Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PSD3Q9NYI0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms