Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKS1Q9NXB0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms