Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAK1IP1Q9NWT1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PAK1IP1Q9NWT1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms