Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNHIT6Q9NWK9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNHIT6Q9NWK9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNHIT6Q9NWK9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNHIT6Q9NWK9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNHIT6Q9NWK9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNHIT6Q9NWK9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNHIT6Q9NWK9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms