Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO28Q9NVF7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO28Q9NVF7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms