Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM30AQ9NV96 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM30AQ9NV96 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms