Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM7SF3Q9NS93 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms