Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.636e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.626e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 HMGB2-204ENST00000506267 629 ntTSL 324.56■■□□□ 1.526e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 TMUB1-206ENST00000488752 584 ntTSL 224.49■■□□□ 1.516e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.186e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.046e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.966e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.96e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 EML2-205ENST00000586195 1952 ntTSL 220.59■□□□□ 0.896e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.866e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 EML2-215ENST00000588308 2062 ntTSL 220.18■□□□□ 0.826e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.716e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.636e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.586e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB10-203ENST00000565031 958 ntTSL 217.9■□□□□ 0.466e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.386e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.056e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 LGALS1-204ENST00000464120 303 ntTSL 214.76□□□□□ -0.056e-11■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB10-205ENST00000570172 495 ntTSL 312.27□□□□□ -0.456e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 TMUB1-207ENST00000492838 550 ntTSL 511.98□□□□□ -0.496e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA2B1-207ENST00000495810 482 ntTSL 211.52□□□□□ -0.576e-11■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 STT3A-201ENST00000392708 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.926e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 LGALS1-206ENST00000480207 185 ntTSL 59.19□□□□□ -0.946e-11■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC8.3□□□□□ -1.086e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 STT3A-205ENST00000525946 1383 ntTSL 26.4□□□□□ -1.396e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 STT3A-207ENST00000526364 617 ntTSL 35.48□□□□□ -1.536e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCDC91-203ENST00000535520 1626 ntTSL 25.35□□□□□ -1.556e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCDC91-217ENST00000543809 1667 ntTSL 1 (best)5.18□□□□□ -1.586e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.66e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCDC91-213ENST00000542801 502 ntTSL 44.21□□□□□ -1.746e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCDC91-210ENST00000540401 1439 ntTSL 1 (best)2.99□□□□□ -1.936e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.765e-10■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.395e-10■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-212ENST00000482069 539 ntTSL 312.24□□□□□ -0.457e-20■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-206ENST00000465692 778 ntTSL 211.51□□□□□ -0.577e-20■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 NMU-204ENST00000509371 283 ntTSL 1 (best)2.3□□□□□ -2.043e-8■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.832e-8■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.62e-8■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.512e-8■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.352e-8■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.252e-9■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 AL662899.3-203ENST00000409691 1903 ntTSL 314.99□□□□□ -0.016e-19■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 218.04■□□□□ 0.481e-6■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.21e-6■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 514.31□□□□□ -0.121e-6■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 TKT-207ENST00000461139 1972 ntTSL 212.45□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 TKT-206ENST00000460343 7286 ntTSL 211.56□□□□□ -0.561e-6■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.833e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.783e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.743e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)16.37■□□□□ 0.213e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-214ENST00000599400 811 ntTSL 515.84■□□□□ 0.133e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 515.75■□□□□ 0.113e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 STXBP2-219ENST00000600702 770 ntTSL 214.22□□□□□ -0.133e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.258e-11■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPS21-204ENST00000450116 418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.448e-11■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-12■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 NMU-206ENST00000515325 616 ntTSL 34.08□□□□□ -1.762e-8■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 PABPN1-206ENST00000556809 969 ntTSL 224.44■■□□□ 1.52e-8■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.265e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.935e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX6B1-203ENST00000590618 290 ntTSL 37.53□□□□□ -1.25e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.929e-11■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.759e-11■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.259e-11■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -09e-11■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.159e-11■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.239e-11■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.39e-11■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.589e-11■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)10.22□□□□□ -0.779e-11■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A3-210ENST00000548480 722 ntTSL 21.93□□□□□ -2.19e-11■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-206ENST00000548984 541 ntTSL 211.23□□□□□ -0.612e-10■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-213ENST00000550964 596 ntTSL 210.94□□□□□ -0.662e-10■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-9■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 LIG1-214ENST00000597146 589 ntTSL 217.34■□□□□ 0.373e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.162e-9■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 LIG1-206ENST00000594067 2697 ntTSL 215.73■□□□□ 0.113e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 LIG1-218ENST00000599322 620 ntTSL 215.49■□□□□ 0.073e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.183e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.53e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 LIG1-207ENST00000594759 4102 ntTSL 1 (best)11.35□□□□□ -0.593e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 LIG1-220ENST00000601091 3957 ntTSL 510□□□□□ -0.813e-7■□□□□ 10.4
APOBEC3CQ9NRW3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-6■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.275e-20■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 314.33□□□□□ -0.125e-20■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.485e-20■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.935e-20■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.375e-20■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-213ENST00000485708 544 ntTSL 25.51□□□□□ -1.535e-20■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS4X-205ENST00000492695 355 ntTSL 37.64□□□□□ -1.194e-24■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS4X-203ENST00000470671 610 ntTSL 33.45□□□□□ -1.864e-24■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL11-202ENST00000443624 994 ntTSL 28.41□□□□□ -1.064e-67■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-7■□□□□ 10.3
APOBEC3CQ9NRW3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-7■□□□□ 10.3
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