Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS4Q9NRS4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms