Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-214ENST00000521267 851 ntTSL 36.15□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 550 ntTSL 36.15□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.595e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 FAM60A-205ENST00000539004 459 ntTSL 53.77□□□□□ -1.815e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 HMGN4-202ENST00000477243 113 ntTSL 33.24□□□□□ -1.895e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.873e-6■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.623e-6■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 SLC25A36-206ENST00000502756 796 ntTSL 238.22■■■■□ 3.713e-10■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 SLC25A36-202ENST00000393015 659 ntTSL 530.51■■■□□ 2.473e-10■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 SLC25A36-214ENST00000515813 738 ntTSL 228.18■■■□□ 2.13e-10■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 SLC25A36-205ENST00000502594 1163 ntTSL 1 (best)27.72■■■□□ 2.033e-10■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.723e-10■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.353e-10■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 SLC25A36-215ENST00000631654 620 ntTSL 521.9■■□□□ 1.13e-10■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.763e-10■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.163e-10■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.213e-6■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 FECH-205ENST00000585747 564 ntTSL 431.82■■■□□ 2.692e-6■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 FECH-203ENST00000585494 1874 ntTSL 231.44■■■□□ 2.622e-6■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 FECH-210ENST00000592699 1049 ntTSL 328.59■■■□□ 2.172e-6■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 FECH-204ENST00000585699 512 ntTSL 425.54■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 GSE1-214ENST00000574293 777 ntTSL 323.81■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 FECH-206ENST00000585878 622 ntTSL 422.35■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 FECH-209ENST00000592111 556 ntTSL 221.48■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 FECH-207ENST00000591215 590 ntTSL 518.04■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-14■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 CCT6P3-202ENST00000426828 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.392e-14■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.333e-7■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 AKAP17A-203ENST00000474361 3232 ntTSL 1 (best)25.49■■□□□ 1.673e-7■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.643e-7■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.965e-16■■■■■ 29.6
DROSHAQ9NRR4 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC19.45■□□□□ 0.74e-8■■■■■ 29.5
DROSHAQ9NRR4 SPACA6-211ENST00000576494 495 ntTSL 319.91■□□□□ 0.782e-7■■■■■ 29.5
DROSHAQ9NRR4 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 14e-7■■■■■ 29.4
DROSHAQ9NRR4 GPX4-202ENST00000585362 859 ntTSL 240.31■■■■■ 4.045e-10■■■■■ 29.4
DROSHAQ9NRR4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.29e-9■■■■■ 29.4
DROSHAQ9NRR4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.179e-9■■■■■ 29.4
DROSHAQ9NRR4 GPX4-209ENST00000593032 583 ntTSL 328.4■■■□□ 2.149e-9■■■■■ 29.4
DROSHAQ9NRR4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.139e-9■■■■■ 29.4
DROSHAQ9NRR4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.899e-9■■■■■ 29.4
DROSHAQ9NRR4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.399e-9■■■■■ 29.4
DROSHAQ9NRR4 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 325.35■■□□□ 1.653e-7■■■■■ 29.4
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-206ENST00000560105 375 ntTSL 215.44■□□□□ 0.067e-10■■■■■ 29.4
DROSHAQ9NRR4 PITPNA-210ENST00000576722 793 ntTSL 342.36■■■■■ 4.379e-7■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 PITPNA-207ENST00000575288 1264 ntTSL 241.89■■■■■ 4.39e-7■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 PITPNA-209ENST00000576010 573 ntTSL 539.82■■■■□ 3.969e-7■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 PITPNA-211ENST00000576761 589 ntTSL 439.82■■■■□ 3.969e-7■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.359e-7■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.359e-7■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 PITPNA-205ENST00000573231 504 ntTSL 416.33■□□□□ 0.29e-7■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 324.37■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 POLR2H-209ENST00000460083 439 ntTSL 325.02■■□□□ 1.62e-7■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 POLR2H-207ENST00000455712 823 ntTSL 319.61■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 CD81-205ENST00000475945 606 ntTSL 227.91■■■□□ 2.064e-7■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.44e-7■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 CD81-215ENST00000530648 558 ntTSL 421.33■■□□□ 14e-7■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 FADS3-210ENST00000531956 841 ntTSL 523.07■■□□□ 1.284e-9■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 FADS3-206ENST00000527379 768 ntTSL 322.93■■□□□ 1.264e-9■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 FADS3-208ENST00000529404 2379 ntTSL 222.24■■□□□ 1.154e-9■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 FADS3-212ENST00000534223 800 ntTSL 521.15■□□□□ 0.984e-9■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 FADS3-211ENST00000533676 5314 ntTSL 218.35■□□□□ 0.534e-9■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.772e-8■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.852e-8■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.281e-15■■■■■ 29.3
DROSHAQ9NRR4 FAM214A-206ENST00000561543 931 ntTSL 338.75■■■■□ 3.793e-9■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 FAM214A-203ENST00000534964 4590 ntTSL 220.82■□□□□ 0.921e-8■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 FAM214A-208ENST00000562351 2993 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 FAM214A-207ENST00000562135 581 ntTSL 513.09□□□□□ -0.311e-8■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 FAM214A-202ENST00000399202 3048 ntTSL 1 (best)10.97□□□□□ -0.651e-8■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.761e-8■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 FAM214A-209ENST00000566768 576 ntTSL 31.96□□□□□ -2.13e-9■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 FAM214A-205ENST00000561490 547 ntTSL 41.49□□□□□ -2.173e-9■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.03□□□□□ -2.43e-7■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 GABBR1-208ENST00000472823 4286 ntTSL 524.08■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.382e-7■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 GABBR1-218ENST00000491829 4212 ntTSL 519.12■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 29.2
DROSHAQ9NRR4 KMT5C-208ENST00000498738 713 ntTSL 534.18■■■■□ 3.061e-7■■■■■ 29.1
DROSHAQ9NRR4 GATD1-204ENST00000465313 446 ntTSL 324.25■■□□□ 1.472e-6■■■■■ 29.1
DROSHAQ9NRR4 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 29
DROSHAQ9NRR4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.77e-6■■■■■ 29
DROSHAQ9NRR4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.823e-17■■■■■ 29
DROSHAQ9NRR4 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.53e-17■■■■■ 29
DROSHAQ9NRR4 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 233.11■■■□□ 2.899e-7■■■■■ 29
DROSHAQ9NRR4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.159e-7■■■■■ 29
DROSHAQ9NRR4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.79e-7■■■■■ 29
DROSHAQ9NRR4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.849e-7■■■■■ 29
DROSHAQ9NRR4 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.559e-7■■■■■ 29
DROSHAQ9NRR4 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 29
DROSHAQ9NRR4 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.429e-7■■■■■ 29
DROSHAQ9NRR4 AP2A1-205ENST00000597774 2196 ntTSL 523.03■■□□□ 1.283e-7■■■■■ 28.9
DROSHAQ9NRR4 AP2A1-206ENST00000600199 2381 ntTSL 522.95■■□□□ 1.273e-7■■■■■ 28.9
DROSHAQ9NRR4 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 28.9
DROSHAQ9NRR4 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 28.9
DROSHAQ9NRR4 BCOR-207ENST00000412952 288 ntTSL 520.25■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 28.9
DROSHAQ9NRR4 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 28.9
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