Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms