Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD2Q9NRG4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms