Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRAC1Q9NRG0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRAC1Q9NRG0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRAC1Q9NRG0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRAC1Q9NRG0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRAC1Q9NRG0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRAC1Q9NRG0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRAC1Q9NRG0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRAC1Q9NRG0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRAC1Q9NRG0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRAC1Q9NRG0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRAC1Q9NRG0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRAC1Q9NRG0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRAC1Q9NRG0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms