Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN3Q9NQS3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECTIN3Q9NQS3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms