Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms