Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH12Q9NPG4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms