Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPCPD1Q9NPB8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPCPD1Q9NPB8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms