Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARD6AQ9NPB6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms