Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLMQ9NP87 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLMQ9NP87 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms