Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFGAP3Q9NP61 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms