Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB6Q9NP58 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB6Q9NP58 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms