Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRM3Q9NNZ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms