Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC24

TMBIM4, Protein lifeguard 4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM4Q9HC24 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMBIM4Q9HC24 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMBIM4Q9HC24 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMBIM4Q9HC24 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms